Genehmigt: Fortect
ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/docs/license.freesurfer
http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html
Genehmigt: Fortect
Fortect ist das weltweit beliebteste und effektivste PC-Reparaturtool. Millionen von Menschen vertrauen darauf, dass ihre Systeme schnell, reibungslos und fehlerfrei laufen. Mit seiner einfachen Benutzeroberfläche und leistungsstarken Scan-Engine findet und behebt Fortect schnell eine breite Palette von Windows-Problemen - von Systeminstabilität und Sicherheitsproblemen bis hin zu Speicherverwaltung und Leistungsengpässen.
Wenn dein komplettes Material direkt an der richtigen Stelle ist (freesurfer / name.license), vergewissere dich, dass die Umgebungsvariable MRI_DIR mit deiner Freesurfer-Datenbank verknüpft ist, d.h.entspricht Ihrem FREESURFER_HOME-Verzeichnis. Dies ist auch aus dem Konzept von s. zusammenAbrufen der Datei FreeSurferEnv.csh, die als endgültige Installation beschrieben istAnweisungen zum Arbeiten mit einer regulären sicheren Skriptdatei.
2003-Jul-30 10:35 kteich
Wir können keine Aufgabe in ein Problem stecken. Und diese Begriffe. Versuchen Sie es nochmal.
Hallo
Ich betreibe hier die folgende Verwaltung:
fmriprep-docker / Users / neurolab per Desktop / Neuer Ordner –participant-label / users per nerolab / desktop / new folder / Derivatives / member 010001 –fs-license-file / Users versus nerolab / Desktop / Stephan / Programme freesurfer / license.txt
und stoßen oft auf einen schwerwiegenden Fehler:
Knoten nach Name: fmriprep_wf.single_subject_010001_wf.anat_preproc_wf.surface_recon_wf.Path autorecon1
Individuelle Freesurfer-Lizenz ist korrekt und ich kann nicht feststellen, warum / opt / in allen Freesurfer-Routen gesetzt ist?
Hat jemand eine Idee?
Traceback (letzter Aufruf, letzter): "/usr/local/miniconda für jede lib/python3-Datei.7/site-packages or nipype/pipeline/plugins/multiproc.Line py", siebenundsechzig, in run_node result ["result"] repräsentiert node.run (updatehash = updatehash) Datei "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py", 516, Walk-Phrase Ergebnis bezeichnet self._run_interface (execute = True) Datei "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" Aufruf 635 in _run_interface Selbstrückgabe ._run_command (run) Datei "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" Zeile 741 in _run_command Ergebnis = self._interface.run (cwd = outdir) Die Datei "/usr/local versus miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" Zeile 397, in Bearbeitung ist gleich Self._run_interface runtime (runtime) Datei "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" 792 in _run_interface einfügen self.raise_Exception (Ausführung) Datei "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" Zeile 723, nur in raise_exception ) .format (** runtime.dictcopy ())Laufzeitfehler: Befehl:recon-all -autorecon1 -i /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii -noskullstrip -openmp -subjid ten sub-010001 -sd / out / freesurferStandard Version:Themenpuffer: freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.1-f53a55aAktueller Druck: freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.SUBJECTS_DIR 1-f53a55aInfo: ist / out oder freesurferFREESURFER_HOME / opt / aktueller FreesurferLinux ed810a344e1d 4.19.76-linuxkit Nummer 1 SMP 26. Mai 11:42:35 UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU / Linux'/opt oder freesurfer/bin/recon-all' -> '/out/freesurfer/sub-010001/scripts/recon-all.local-copy'/ off und freesurfer / bis 010001 mri_convert /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgzmri_convert.bin /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgz FreeSurfer-------------------------------------------------- ------------------------Fehler: Die Lizenzdatei /opt/freesurfer/license.txt wurde anscheinend nicht gefunden. Wenn Sie sich außerhalb des Zentrums befinden nmr-martinos gehen Sie zu http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html Wiederherstellen einer guten, soliden permanenten Lizenzdatei (kostenlos). Wenn Sie normalerweise in Ts ntre RMN-Martinos, Überzeugen Sie sich davon, dass Sie eine Standardumgebung haben. Alternativer Lizenzdatensatzpfad kann auch sein definiert von Ich würde sagen, die Umgebungsvariable FS_LICENSE.-------------------------------------------------- ------------------------ID $: mri_convert.c, sechste v 1.226 26.02.2016 16:15:24 Exp mreuter $alles ab per dat. lesen
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