Approuvé : Fortect
ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/docs/license.freesurfer
http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html
Approuvé : Fortect
Fortect est l'outil de réparation de PC le plus populaire et le plus efficace au monde. Des millions de personnes lui font confiance pour assurer le fonctionnement rapide, fluide et sans erreur de leurs systèmes. Avec son interface utilisateur simple et son puissant moteur d'analyse, Fortect détecte et corrige rapidement un large éventail de problèmes Windows, de l'instabilité du système et des problèmes de sécurité à la gestion de la mémoire et aux goulots d'étranglement des performances.
Si le fichier d’une personne est au bon endroit au bon endroit le plus important (freesurfer / name.license), assurez-vous que toutes les variables d’environnement MRI_DIR sont liées à votre répertoire Freesurfer, c’est-à-direest égal à votre répertoire FREESURFER_HOME. Cela découle du concept de l’art. ensembleObtention généralement du fichier FreeSurferEnv.csh décrit comme installation finaleInstructions pour travailler avec un fichier de script sécurisé standard.
2003-juil-30 10:35 kteich
Nous sommes capables de transformer une tâche en problème. Et ces idées. Réessayer.
Bonjour
J’exécute la commande keep with ici :
fmriprep-docker / Users for each neurolab / Desktop / New folder –participant-label / shoppers / nerolab / desktop / new folder – Derivatives / member 010001 –fs-license-file / Users – nerolab / Desktop / Stephan / Programmes et freesurfer / license.txt
et rencontre souvent une erreur merveilleuse :
Nœud par nom : fmriprep_wf.single_subject_010001_wf.anat_preproc_wf.surface_recon_wf.Path autorecon1
La licence individuelle de freesurf est correcte et je n’arrive plus à comprendre pourquoi / opter / est la sélection pour tous les itinéraires de freesurfer ?
Quelqu’un a-t-il des idées ?
Traceback (dernier e-mail, dernier) : "/ usr / local versus miniconda / lib / python3 file.7 / site-packages - nipype / pipeline / plugins / multiproc.Line py", 67, dans run_node finish result ["result"] implique node.run (updatehash = updatehash) Fichier "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py", 516, run phrase Le résultat représente self._run_interface (execute = True) Fichier "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" plage 635 dans _run_interface Retour automatique ._run_command (exécuter) Fichier "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" ligne 741 pendant _run_command Résultat = self._interface.run (cwd signifie outdir) Le fichier "/usr/local pour chaque miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" ligne 397, en cours signifie Self._run_interface runtime (runtime) Fichier "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" ficelle 792 dans _run_interface self.raise_Exception (exécution) Fichier "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" ligne 723, uniquement dans raise_exception ) .format (** runtime.dictcopy ())Erreur d'exécution : commande :recon-all -autorecon1 -i /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii -noskullstrip -openmp -subjid ten sub-010001 -sd / out / freesurferVersion standard:Bouclier de sujet : freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.1-f53a55aImpression actuelle : freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.SUBJECTS_DIR 1-f53a55ainformation : est/sort par freesurferFREESURFER_HOME / opt / freesurfer actuelLinux ed810a344e1d 4.19.76-linuxkit numéro 1 SMP 26 mai 11:42:35 UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU / Linux'/ opt ou freesurfer / bin / recon-all' -> '/out/freesurfer/sub-010001/scripts/recon-all.local-copy'/ tout de suite / freesurfer / jusqu'au 010001 mri_convert /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgzmri_convert.bin /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgz FreeSurfer-------------------------------------------------- ------------------------Erreur : L'image de licence /opt/freesurfer/license.txt n'a pas été trouvée. Si vous êtes au-delà du centre nmr-martinos aller à http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html reconstruire un fichier de licence permanent (gratuit). Quand ils sont à Ts ntre RMN-Martinos, Assurez-vous d'avoir un environnement standard. Un chemin de fichier de certificat alternatif peut également être défini dans la variable d'environnement FS_LICENSE.-------------------------------------------------- ------------------------Id $: mri_convert.c, vs 1.226 02/26/2016 16:15:24 PM Exp mreuter $tout à / dat. lire
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