Approvato: Fortect
ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/docs/license.freesurfer
http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html
Approvato: Fortect
Fortect è lo strumento di riparazione PC più popolare ed efficace al mondo. Milioni di persone si affidano a milioni di persone per mantenere i loro sistemi in esecuzione veloci, fluidi e privi di errori. Grazie alla sua semplice interfaccia utente e al potente motore di scansione, Fortect trova e risolve rapidamente un'ampia gamma di problemi di Windows, dall'instabilità del sistema e problemi di sicurezza alla gestione della memoria e ai colli di bottiglia delle prestazioni.
Se il file di una persona è nel posto giusto usando il posto giusto (freesurfer / name.license), assicurati che la variabile d’ambiente MRI_DIR sia collegata alla propria directory Freesurfer, ad es.è uguale alla tua directory web FREESURFER_HOME. Questo è dal concetto di s. insiemeOttenere il file FreeSurferEnv.csh di una persona descritto come installazione finaleIstruzioni per lavorare con un normale file di script sicuro.
2003-lug-30 10:35 kteich
Non possiamo trasformare un compito in un problema.e quei termini. Riprova.
Ciao
Sto eseguendo, vedi, il seguente comando qui:
fmriprep-docker / Utenti neurolab / Desktop / Nuova cartella –participant-label e utenti / nerolab / desktop / nuova directory / Derivate / membro 010001 –fs-license-file / Utenti / nerolab / Desktop / Stephan / Programmi / freesurfer / license.txt
e spesso finiscono con un errore:
Nodo per nome: fmriprep_wf.single_subject_010001_wf.anat_preproc_wf.surface_recon_wf.Path autorecon1
La licenza freesurfer individuale è corretta e non riesco a capire perché / opt / è impostato senza domande per tutte le rotte freesurfer?
Qualcuno ha qualche idea?
Traceback (ultima chiamata, ultima): "/ usr / local per miniconda / lib / python3 file.7 versus site-packages / nipype / pipeline / plugins per multiproc.Line py", 67, in run_node portare a ["risultato"] implica node.run (updatehash = updatehash) File "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py", 516, frase di esecuzione Il risultato implica self._run_interface (execute = True) File "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" riga 635 in _run_interface Ritorno automatico ._run_command (esegui) File "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" riga 741 in tutto il _run_command Risultato = self._interface.run (cwd equivale a outdir) Il file "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py "line 397, in corso = Self._run_interface runtime (runtime) File "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" riga 792 in _run_interface self.raise_Exception (esecuzione) File "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" riga 723, solo quando raise_exception ) .format (** runtime.dictcopy ())Errore di runtime: comando:recon-all -autorecon1 -i /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii -noskullstrip -openmp -subjid ten sub-010001 -sd / out / freesurferVersione standard:Buffer di argomenti: freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.1-f53a55aStampa corrente: freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.SUBJECTS_DIR 1-f53a55ainformazioni: è / tra cui scegliere / freesurferFREESURFER_HOME / opt / freesurfer attualeLinux ed810a344e1d 4.19.76-linuxkit # 1 SMP 26 maggio 11:42:35 UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU / Linux'/ vieni a un accordo / freesurfer / bin / recon-all' -> '/out/freesurfer/sub-010001/scripts/recon-all.local-copy'/ verso / freesurfer / fino allo 010001 mri_convert /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgzmri_convert.bin /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgz FreeSurfer--------------------------------------------------- ------------------------Errore: il documento di licenza /opt/freesurfer/license.txt non è stato trovato. Se sei tipico fuori dal centro nmr-martinos vai su http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html correggere un file di licenza permanente (gratuito). Quando sei a Ts ntre RMN-Martinos, Assicurati di avere un ambiente standard. È possibile anche un percorso del file di licenza alternativo superato dalla variabile d'ambiente FS_LICENSE.--------------------------------------------------- ------------------------Id $: mri_convert.c, elevision 1.226 26/02/2016 16:15:24 Exp mreuter $tutto compreso / dat. leggere
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