Als u de daadwerkelijke foutmelding over het genetische netwerk ontvangt, is de gebruikershandleiding van vandaag gemaakt om u te helpen.
Goedgekeurd: Fortect
Hervatten
Verschillende onderzoeken hebben zich gericht op de impact-gerelateerde willekeurige bostechnieken vanwege hun superieure algehele prestaties. Sommige van deze inferentiemethoden hebben ook uw robuuste vermogen om tijdreeksen net zo efficiënt te analyseren als genexpressiegegevens te bepalen. Ze zijn echter meestal alleen nuttig voor het rangschikken van al hun regels en voorschriften door aspecten van vertrouwen te koppelen. Niemand heeft de specifieke plannen kunnen ontdekken die het gen beïnvloeden dat het vaakst gecorreleerd is met interesse. In deze studie stellen we deze benaderingsmethode voor voor het verwijderen van weinig veelbelovende kandidaat-regels, in wezen het toevoegen van willekeurige bosinferentie met een aantal selectiemethoden. Als onderdeel voor het detecteren van schadelijke regels, gebruikt ons platform de resultaten van promotieselectieprocedures om de betrouwbaarheidsprijsbereiken van bijna impliciete wettelijke vereisten te evenaren die feitelijk zijn berekend met behulp van op op inferentie gebaseerde methoden. Numerieke experimenten, die aantoonden dat onze gecombineerde toepassing met kenmerkselectiemethoden het specifieke gebruik van willekeurige bosinferentie in 98 verbeterde, evenals van 100 experimenten die werden uitgevoerd op onze eigen vervalsingsproblemen. De verbetering is echter over het algemeen klein omdat onze methode collectief populair is geworden en niet meer dan 19% van mogelijke wettelijke richtlijnen heeft opgeschoond en verwijderd. De combinatietoepassing helpt, naast het doelselectieproces, ook om de rekeninspanningen te vergroten. Hoewel een grotere doorbraak met minder rekenkundige totale prijs ideaal zou zijn, zien we geen obstakel dat ons onderzoek kan doen, aangezien ons doel is om zoveel mogelijk bruikbare informatie uit die beperkte hoeveelheid genfrasegegevens te halen. PHANTOM5,
Trefwoorden: genexpressie, eigenschapselectie, doelloos bos, erfelijke netwerkafleiding
1. Presentatie
De dynamische respons van genexpressie bepaalt veel cellulaire functies. Ons begrip van biologische voordelen vereist de studie van complexe patronen in genregulatie, aangezien regulatie tussen uw genen en bepaalt welke genen tot expressie worden gebracht. Een veiligere benadering die is ontwikkeld met betrekking tot de analyse van inclusieve genregulatie is de gedeeltelijke locatie. In een genetische netwerktaak wordt de algemene regulatie tussen genen afgeleid van genevolutiegegevens gemeten met biologische microarray-achtige technologieën naar RNA-Seq met behulp van slice-sequencers. Volgende leeftijd, enz. Afgeleide klassenmodellen kunnen idealiter dienen als hulpmiddelen om biologen te helpen hypothesen op te stellen en hun experimenten te plannen. Daarom zijn veel onderzoekers geïnteresseerd in het effect van genetische netwerken.
Een aantal vormen voor de afleiding van genetische systemen zijn niet zo lang geleden voorgesteld (Larrañaga et al., 2006; Meyer et., 2008; Chou en Voit, 2009; Hecker et., 2009; Matos de Simoes en Emmert -Streib, 2012; Emmert-Streib alors al., 2012; Glass et al., 2013). Bij individuen beloven willekeurige bosblootstellingsmethoden een uitstekende geste (Huynh-Thu et al., 2010; Maduranga et al., 2013; Petralia et., 2015; Huynh-Thu en Geurts, 2018; And kimura al., 2019). … Sommige van deze inferentieapparaten kunnen ook zowel tijdreeksen als gegevens over genexpressie van ruis vergelijken (Petralia et al., 2015; Huynh-Thu en Geurts, 2018; Et kimura al., 2019). Tijdelijke gegevens De e reeks is een reeks bedreeksen van genexpressieniveaus gemeten op opeenvolgende minutenpunten na stimulatie. Statische getallen zijn sets van genexpressieniveaus onder stationaire omstandigheden. Op bos gebaseerde willekeurige inferentie verwerkt expressiegegevens van genvooronderzoek door matchwaarden toe te wijzen aan alle kandidaat-praktijken. Hoewel veel methoden voor genetische inferentienetwerken proberen de regels te vinden die daadwerkelijk in het doelnetwerk zijn opgenomen, is willekeurige, op bos gebaseerde hardware alleen kandidaat-kandidaten, waarbij een vertrouwenswaarde wordt toegekend aan bijna en ook aan kandidaat. Toen biologen ontslagen werden om experimenten uit te voeren om vermeende regulerende genen te helpen bevestigen, hadden eerder betrouwbaarheidswaarden kunnen worden gemaakt die zijn berekend op het moment van willekeurige bosgebaseerde methoden om de volgorde van experimenten te bepalen. Effectmethoden op basis van willekeurige bossen zouden echter nieuw bruikbaar zijn als ze dit speciale vermogen hadden om de genen te herkennen die het type gen van belang dicteren.
Alle inferentietoepassingen combineren Op basis van willekeurige bossen met een bepaald kenmerkselectieprogramma konden we de beperkingen selecteren die in uw huidige genetische netwerk aanwezig zijn. Functieselectie, een techniek die wordt bestudeerd over computationele intelligentie, verwijdert variabelen die relevant zijn voor de bron in een goede pasvorm of classificatieprobleem (Guyon en Elisseeff, 2003; Cai et al., 2018). In voorlopige experimenten hebben we echter ontdekt dat een fantastische combinatiemethode die een willekeurig bosgericht vermogen combineert met een van de bestaande schermresolutiemethoden voor kenmerken er vaak niet in slaagt om de genen te identificeren die het zwakste effect op het gen hebben, samen met interesse. De belangrijkste focus van bestaande karakteriseringsbindingsmethoden kan dit falen verklaren, omdat sommige eenvoudige stappen niet zijn ontworpen om elk van deze inputs te identificeren waarop de variabelen daadwerkelijk alle output beïnvloeden, maar om input te zoeken via componenten die de prestaties van de bron zullen verbeteren . voorspeld om dit resulterende model te maximaliseren. Onze groepering heeft onlangs een nieuwe methode voor het selecteren van kenmerken ontwikkeld die tot doel heeft alle functies te vinden. Aanbevolen variabelen die vaak echt van invloed zijn op het resultaat, en om zoveel mogelijk onbelangrijke invoervariabelen te verliezen als geloofwaardig (Kimura en Tokuhisa, 2020) / p>
In dit artikel stellen we een methode voor om minder heldere kandidaatposities te elimineren door een methode met willekeurige boseffecten te combineren met de innovatieve methode voor het selecteren van kenmerken die we hebben ontwikkeld in Kimura en Tokuhisa (2020), net zo succesvol als twee aangepaste versies. Het karakteriseren van de methoden die normaal in dit onderzoek worden gebruikt, houdt doorgaans niet alleen in dat een paar irrelevante bijdragende variabelen worden gevonden, maar ook het delegeren van vertrouwen aan de invoervariabelen om de waarschijnlijkheid ervan aan te tonen dat een persoon hun integratie daadwerkelijk beïnvloedt. In onze gecombineerde methode kunnen we alle betrouwbaarheidswaarden gebruiken die zijn berekend door alle functieselectieprocedures om de waarschijnlijkheidswaarden te matchen die zijn toegewezen aan elk van de n kandidaatregels met behulp van de willekeurige bosmiddelen.
De andere in dit manuscript is als volgt goed voorbereid. In sectie 2 presenteren we een logische gevolgtrekking op basis van een willekeurig bos dat door deze studie is gebruikt. In sectie 3 beschrijven we de volledige methoden voor het kiezen van het uiterlijk en leggen we hun mogelijkheid uit om ze te combineren met het geheim dat verband houdt met de uitvoer. We bevestigen de effectiviteit van onze gecombineerde methode, aangegeven door numerieke experimenten met behulp van ongegronde en biologische genexpressiegegevens in secties 2 en 5. Ten slotte zal dit in sectie 6 worden afgerond met het toekomstige werk van iemands bedrijf. / P>
2. Afleidingsmethode op basis van willekeurig bos
Zoals eerder vermeld, combineert deze feitenstudie de invloed van de willekeurige houtmethode met een aantal benaderingen om selectie op te nemen. Hoewel dit kan worden gedaan met bijna elke willekeurige bosgebaseerde methode, gebruiken we in deze studie een inferentiemethode (Kimura et al., 2019) situatie voor het analyseren van zowel tijdreeksen als ruisgenexpressiegegevens. Het gedeelte van dit voorstel geeft informatie over de opnamemethode.
2.1. Model voor het beschrijven van genetische netwerken
De inferentiemethode die in een bepaald onderzoek wordt gebruikt, vertegenwoordigt een genetisch netwerk dat elke set op differentiaalvergelijkingen gebruikt, vaak met de vorm
waarbij X −n (X 1 , = â ‹¯â € ‰, X n−1 , X chemisch + 1 , â ‹¯â € ‰, X N ), X m (m is gelijk aan 1, 2, â‹ ¯â € ‰, N ) is het expressieniveau van het mth-gen, N is het aantal genen dat het doelnetwerk bevat, Î n (> 0) is een constante parameter en daarom is F n een functie random body.
Met dit model krijgen we een ouder netwerk, waarbij we de functie F t krijgen naast de parameter β g (n = 1, alleen â ‹¯ .. ., N), die in de loop van de tijd opeenvolgende veranderingen veroorzaken met betrekking tot de waargenomen niveaus die verband houden met genexpressie. De overeenkomstige sectie is ongetwijfeld een van de manieren om ze te beveiligen.
2.2. Afgeleid van F N en β N
De Effects-methode (Kimura et al., 2019) verdeelt de effectenconditie van een genetisch netwerk bestaande uit N genen in N subtaken, die elk overeenkomen met elk gen. Door je n-de deelprobleem op te lossen, verkrijgt een methode een conservatieve benadering van het vermogen F n en de beste bescheiden waarde voor de parameter β d . De rest van deze paragraaf beschrijft het nde deelprobleem.
2.2.1. De ziekte identificeren
Methode-effecten die in dit onderzoek zijn gebruikt, hebben in het bladeren een significante benadering van de functie F n en een verhoogde waarde samen met de parameter β n thr.
Goedgekeurd: Fortect
Fortect is 's werelds meest populaire en effectieve pc-reparatietool. Miljoenen mensen vertrouwen erop dat hun systemen snel, soepel en foutloos blijven werken. Met zijn eenvoudige gebruikersinterface en krachtige scanengine kan Fortect snel een breed scala aan Windows-problemen vinden en oplossen - van systeeminstabiliteit en beveiligingsproblemen tot geheugenbeheer en prestatieproblemen.
Versnel de prestaties van uw computer nu met deze eenvoudige download.