Om du får alla felmeddelanden i det genetiska nätverket skapades dagens användarhandbok för att hjälpa dig.
Godkänd: Fortect
Återuppta
Flera studier har fokuserat på den effekt som oftast är förknippad med slumpmässiga skogstekniker på grund av deras överlägsna prestanda. Några av dessa inferensmetoder har också en specifik robust förmåga att analysera tidsserier som faktiskt bestämmer genuttrycksdata. Men de fortsätter bara att vara användbara för att rangordna alla sina begränsningar genom att länka aspekter av förtroende. Ingen av konsumenterna har kunnat upptäcka de specifika rekommendationer som faktiskt påverkar den gen som oftast förenas med intresse. I denna studie föreslår vi en sådan metod för att ta bort lågt lovande kandidatregler, i huvudsak blanda samman slumpmässig skogsinferens med ett antal ha urvalsmetoder. Som en komponent för att upptäcka fruktansvärda regler använder vår plattform resultaten av besitter urvalsförfaranden för att matcha förtroendeutlåtandena från nästan underförstådda lagkrav som faktiskt beräknades med slutsatsbaserade metoder. Numeriska experiment, som visade att vår egen kombinerade applikation med funktionsvalsmetoder förbättrade hela användningen av slumpmässig skogsinferens i 98 erbjudna av 100 experiment utförda på våra egna falska problem. Förbättringen är dock generellt liten främst för att vår metod har blivit kollektivt populär och inte raderat mer än 19% av möjliga regleringsalternativ. Kombinationsprogrammet, förutom att förse dig med urvalsprocessen, hjälper också till att öka beräkningsbara prislappar. Även om ett större genombrott med mindre beräkningskostnader skulle vara idealiskt, ser vi inget hinder så att du kan vår forskning, eftersom vårt mål är att få så mycket användbar information som möjligt från specifik begränsad mängd genfrasdata. PHANTOM5,
Nyckelord: genuttryck, val av egenskaper, mållös skog, dåliga gener nätverksavledning
1. Presentation
Det dynamiska svaret hos genuttryck bestämmer många cellulära funktioner. Vår förståelse av biologiska tillgångar kräver studier av komplexa mönster ur genreglering, eftersom reglering mellan dina gener och bestämmer information om hur gener uttrycks. Ett säkrare tillvägagångssätt som utvecklats för analys av inkluderande genreglering är medfödd plats. I en genetisk nätverksuppgift härleds allroundreglering mellan gener från genresedata mätt med biologiska mikroarrayliknande tekniker till RNA-Seq med hjälp av skivsekvenseringar. Nästa ålder, etc. Modeller med härledda anställda kan idealiskt fungera som verktyg för att bättre biologer ska kunna skapa hypoteser och planera sina experiment. Därför har många forskare varit intresserade av att de påverkar genetiska nätverk.
Ett antal rutiner för härledning av genetiska system har nyligen föreslagits (Larrañaga et al., 2006; Meyer et ‘s., 2008; Chou och Voit, 2009; Hecker et., 2009; Matos de Simoes och Emmert -Streib, 2012; Emmert-Streib d’autant plus al., 2012; Glass et al., 2013). Bland individer utlovar slumpmässiga skogsexponeringsmetoder utmärkt sexuell prestanda (Huynh-Thu et al., 2010; Maduranga et al., 2013; Petralia et., 2015; Huynh-Thu och Geurts, 2018; Och kimura al., 2019). … Några av dessa slutsatser kan också jämföra både tidsserier och stationära genuttrycksdata (Petralia et al., 2015; Huynh-Thu och Geurts, 2018; Et kimura al., 2019). Data tillfälligt Th -serien är en serie omgångar av genuttrycksnivåer som mäts vid successiva ansträngningspunkter efter stimulering. Statiska tal är uppsättningar inom nivåer av genuttryck under stationära förhållanden. Skogsbaserad slumpmässig inferens bearbetar expressionsdata från genundersökningar genom att tilldela matchningsvärden till alla kandidatstandarder. Medan många metoder för genetisk inferensnätverk söker efter att hitta de regler som faktiskt finns i målnätverket, satsar slumpmässig skogsbaserad hårdvara bara kandidater och tilldelar ett förtroendevärde till nästan därför att kandidaten. När biologer avfyrade för att genomföra experiment – bekräfta förmodade regleringsgener, kunde konfidensvärden beräknade i princip slumpmässiga skogbaserade metoder tidigare ha använts för att bestämma experimentens ordning. Effektsmetoder baserade på slumpmässiga skogar skulle dock vara mer användbara om de hade denna speciella förmåga som hjälper till att känna igen de gener som faktiskt dikterar själva genen av intresse.
Att kombinera alla slutsatser Baserat på slumpmässiga skogar med ett program för att välja egenskaper kunde vi känna till de begränsningar som faktiskt finns i det genetiska nätverket. Funktionsval, en teknik som studeras i beräkningsmässig intelligens, tar bort variabler som är relevanta för användningen vid en bra passform eller klassificeringssvårigheter (Guyon och Elisseeff, 2003; Cai et al., 2018). Men i preliminära experiment har vi funnit att denna kombinationsmetod som kombinerar en slumpmässig skog byggd förmåga med en av de befintliga funktionstillfredsställelsesmetoderna ofta inte identifierar de gener som kommer att ha den svagaste effekten på genen av mest intresse. Huvudfokus för befintlig karaktärisering av nätmetoderna kan förklara detta misslyckande, eftersom vissa alternativ inte är utformade för att identifiera var och en av dina ingångar som variablerna faktiskt påverkar dessa utdata på, utan att leta efter ingångar genom komponenter som förbättrar avkastningens prestanda . prognos för att maximera den resulterande modellen. Vår familjenhet utvecklade nyligen en ny metod för val av funktioner som syftar till att hitta alla funktioner Rekommenderade variabler som experter hävdar verkligen påverkar resultatet, samt ta ut så många oviktiga ingångsvariabler som en möjlighet (Kimura och Tokuhisa, 2020) / p>
I den här artikeln föreslår vi en metod för att eliminera mindre sannolika kandidatpositioner genom att kombinera en slumpmässig skogseffektmetod med den innovativa metoden för val av funktioner som alla har utvecklat i Kimura och Tokuhisa (2020), samt två anpassade versioner. Att karakterisera de metoder som avses i denna studie innebär vanligtvis att inte bara avskaffa några irrelevanta bidragande variabler, utan också att arbeta med förtroende för inmatningsvariablerna för att visa var och en av våra sannolikheter att en person faktiskt påverkar deras användning. I vår kombinerade metod kan vi använda hur konfidensvärdena som beräknas av alla funktionsvalsutrustningar matchar sannolikhetsvärdena som tilldelats var och en av n kandidatregler med hjälp av slumpmässigt skogsmetod.
Den andra i detta manuskript är snyggt enligt följande. I avsnitt 2 presenterar vi den faktiska logiska slutsatsen baserad på en slumpmässig skog som används i denna studie. I avsnitt 3 beskriver vi en persons metoder för att välja utseende och förklarar ofta möjligheten att kombinera dem med hemligheten bland utgången. Vi bekräftar effektiviteten av en kombinerad metod som indikeras av numeriska experiment med oberättigade och biologiska genuttrycksdata i avsnitt d och 5. Slutligen kommer detta att avslutas genom avsnitt 6 med det enskilda företagets framtida arbete. / P>
2. Inferensmetod baserad på slumpmässig skog
Som tidigare nämnts kombinerar denna lägesstudie påverkan av den slumpmässiga första metoden med ett antal tillvägagångssätt för karaktäristiskt urval. Även om detta kan göras med någon slumpmässig skogsbaserad metod, utnyttjar vi i denna studie en inferensmetod (Kimura et al., 2019) som är tillförlitlig för att analysera både tidsserier och ljudgenuttrycksdata. Avsnittet i detta förslag formar uttagningsmetoden.
2.1. Modell för beskrivning av genetiska nätverk
Inferensmetoden som används i en viss studie förtydligar ett genetiskt nätverk som använder varje uppsättning differentialekvationer, ofta med sin form
där X −n (X 1 , = â ‹¯â € ‰, X n−1 , X debbie + 1 , â ‹¯â € ‰, X N ), X m (m är lika med 1,2 ) är en konstant parameter och därför är F n en funktion slumpmässig typ.
Med denna modell får vi ett arvsnätverk som får funktionen F in utöver parametern <² g (n = 1, bara â ‹¯ .. ., N), som orsakar sekventiella förändringar över ett ögonblick med avseende på de observerade nivåerna för genuttryck. Motsvarande avsnitt är ett av de sätten att säkra dem.
2.2. Hämtat från F N Och β N
Effekten -metoden (Kimura et al., 2019) delar upp effektförhållandet för ett genetiskt nätverk bestående av N -gener i N -deluppgifter, som var och en matchar varje gen. För att lösa ditt n: e delproblem får denna metod en konservativ approximation av att få jobbet gjort F n och det bästa billiga värdet för parametern <² och . Resten av detta avsnitt beskriver det stora nya n: e delproblemet.
2.2.1. Identifiera baksidan
Metodeffekter som används i denna studie I undersökningen har du en betydande approximation till funktionen F n och ett ökat värde avseende parametern <² n thr.
Godkänd: Fortect
Fortect är världens mest populära och effektiva PC-reparationsverktyg. Det litar på miljontals människor för att hålla sina system igång snabbt, smidigt och felfritt. Med sitt enkla användargränssnitt och kraftfulla skanningsmotor hittar och fixar Fortect snabbt ett brett utbud av Windows-problem – från systeminstabilitet och säkerhetsproblem till minneshantering och prestandaflaskhalsar.
