Godkänd: Fortect
ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/docs/license.freesurfer
http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html
Godkänd: Fortect
Fortect är världens mest populära och effektiva PC-reparationsverktyg. Det litar på miljontals människor för att hålla sina system igång snabbt, smidigt och felfritt. Med sitt enkla användargränssnitt och kraftfulla skanningsmotor hittar och fixar Fortect snabbt ett brett utbud av Windows-problem – från systeminstabilitet och säkerhetsproblem till minneshantering och prestandaflaskhalsar.
Om din fil verkligen är på rätt plats på rätt webbplats (freesurfer / name.license), se till att MRI_DIR liggande variabel är länkad till din Freesurfer -katalog, d.v.s.är densamma som din FREESURFER_HOME -katalog. Detta är ett resultat av begreppet s. tillsammansAtt få FreeSurferEnv.csh komplett beskrivs som slutinstallationInstruktioner för att arbeta med en särskild vanlig säker skriptfil.
2003-jul-30 10:35 kteich
Vi kan inte förvandla den senaste uppgiften till ett problem. Och dessa villkor. Försök igen.
Hej
Jag kör följande kommando korrekt här:
fmriprep-docker / Users / neurolab / Desktop / New folder –participant-label / users or nerolab / desktop / new folder / Derivatives per member 010001 –fs-licens-file / Users / nerolab per Desktop / Stephan / Program / freesurfer – licens.txt
och stöter ofta på ett fel:
Node by name: fmriprep_wf.single_subject_010001_wf.anat_preproc_wf.surface_recon_wf.Path autorecon1
Individuell freesurferlicens är korrekt och jag kan inte räkna ut varför / opt / är inställd för var och en av freesurferrutter?
Någon som har några ritningar?
Traceback (senaste samtal, senaste): " / usr / local / miniconda versus lib / python3 file.7 / site-packages / nipype versus pipeline / plugins / multiproc.Line py", 67, operativ i run_node resultat ["resultat"] rekommenderar node.run (updatehash = updatehash) Filen "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py", 516, erbjuder fras Resultatet innebär self._run_interface (exekvera innebär sant) Fil "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" rad 635 från _run_interface Self-return ._run_command (kör) Fil "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/pipeline/engine/nodes.py" rad 741 i _run_command Resultat = self._interface.run (cwd = outdir) Filen "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" rad 397 pågår = Self._run_interface runtime (runtime) Fil "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" rad 792 till _run_interface self.raise_Exception (körning) Fil "/usr/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/nipype/interfaces/base/core.py" rad 723, endast i raise_exception ) .format (** runtime.dictcopy ())Körtidsfel: kommando:recon -all -autorecon1 -i /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii -noskullstrip -openmp -subjid 10 sub -010001 -sd out/freesurferStandardversion:Ämnesbuffert: freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.1-f53a55aNuvarande publikation: freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.SUBJECTS_DIR 1-f53a55ainformation: är / ut / freesurferFREESURFER_HOME eller opt / current freesurferLinux ed810a344e1d 4.19.76-linuxkit # a single SMP 26 maj 11:42:35 UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU / Linux'/opt/freesurfer och bin/recon-all'-> '/out/freesurfer/sub-010001/scripts/recon-all.local-copy'/ off eller freesurfer / till 010001 mri_convert /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgzmri_convert.bin /data/sub-010001/ses-02/anat/sub-010001_ses-02_T1w.nii /out/freesurfer/sub-010001/mri/orig/001.mgz FreeSurfer---------------------------------------------------------- ------------------------Fel: Licensfilen /opt/freesurfer/license.txt hittades inte. Om du är utanför hur centrum nmr-martinos går till http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html återställa en evig licensfil (gratis). När du är när Ts ntre RMN-Martinos, Se till att dina behov har en standardmiljö. Alternativ licensfilväg kan också vara definieras av miljövariabeln FS_LICENSE.---------------------------------------------------------- ------------------------Id $: mri_convert.c, v 1.226 26/2/2016 16:15:24 PM Exp mreuter $allt från eller dat. läsa
Snabba upp din dators prestanda nu med denna enkla nedladdning.